Polémicas
Alfonso Rojo ha sido protagonista de varias polémicas. Su nombre aparece relacionado en noticias sobre el caso Blesa y el comisario Villarejo, y en referencia a una condena de la Audiencia de Madrid por no retirar artículos del medio que dirige, y ha recibido acusaciones de manipulación.
En abril de 2014 fue expulsado del plató del programa La Sexta Noche por llamar "gordita" a la portavoz de la PAH, Ada Colau. Después del revuelo causado por sus declaraciones, aseguró que la causa de la polémica fueron los "126.000 piojosos" que seguían a Colau en Twitter.
En el programa La Sexta Noche del 15 de marzo de 2014, Alfonso Rojo calificó al líder de Podemos, Pablo Iglesias, de "chorizo", "mangante", "estafador" y "gilipollas", y también le acusó de "cobrar de todos los asesinos del mundo", por lo que, si bien, en un primer momento se dijo que sería denunciado por la formación política, finalmente fue el propio Iglesias quien puso el asunto en manos de los tribunales, como puede verse en la sentencia. El 22 de junio de 2016, el juzgado de primera instancia de Madrid condenó a Alfonso Rojo a pagar 20 000 euros de indemnización a Pablo Iglesias por intromisión ilegítima al honor. Rojo recurrió, pero el 21 de septiembre del mismo año la Audiencia Provincial de Madrid ratificó la sentencia. En octubre de 2017 el Tribunal Supremo confirmó la condena y rebajó la indemnización a 6000 euros. En este caso, Alfonso Rojo fue también condenado a publicar, en el medio que dirige, los hechos probados y el fallo de la sentencia. Los jueces tuvieron en cuenta los insultos vertidos en el programa televisivo "El Cascabel", y en Twitter, donde llamó a Iglesias "gilipollas" y "sinvergüenza".
El 11 de diciembre de 2014 Rojo concedió una entrevista en su programa de Radio 4G con el cofundador de la página web meneame.net Ricardo Galli para hablar de la nueva Ley de Propiedad Intelectual por la que se establecía el "canon AEDE". En la entrevista acusó al informático de tener la web repleta de troles, de favorecer la aparición de noticias benévolas con Podemos y de interferencias por parte de los responsables para evitar dar relevancia a Periodista Digital y El Semanal Digital. Tras estas acusaciones, Galli colgó el teléfono en pleno directo.
El 20 de febrero de 2015, en una tertulia de Castilla-La Mancha Televisión, ante las preguntas por parte de Beatriz Talegón (política del PSOE) a los periodistas presentes en el plató, Rojo increpó de manera reiterativa a dicha política por "haberse puesto gorda". Al finalizar la entrevista a la citada política, Rojo se dirigió a la presentadora para preguntarle de qué "sórdida pizzería" había traído a la invitada. Por estos motivos, el Comité de Empresa de RTVCM pidió prescindir de Alfonso Rojo en la cadena pública.
Debido a los polémicos comportamientos del periodista, varios medios de comunicación reaccionaron contra él. En 2015 Tele Madrid prescinde de sus servicios. En 2016 TVE apartó al periodista de los programas políticos.
Ha sido acusado de mantener una relación de dependencia con el Partido Popular, de causar indignación en la audiencia, y ha terminado siendo expulsado de sus programas. Algunos medios en 2015 clasificaron a Alfonso Rojo como uno de "los diez voceros de la derecha mediática que pueden llegar a cabrearte", aludiendo al denominador común de todos ellos para "predicar teorías alarmistas" que frenen al 15-M.
El director de Periodista Digital insulta a los jóvenes del 15-M en una tertulia: "No tienen ni pajolera idea".
Se le ha acusado de utilizar un medio público como Telemadrid para promocionar un medio privado como su periódico digital.
En 2015, los comportamiento de Alfonso Rojo causaron indignación y reproches en redes sociales por afirmar en el programa de La Sexta Al Rojo Vivo: "La podemita Tania Sánchez, novia de Pablo Iglesias, se descoca y enseña 'canalillo'", y reconoce él mismo en Twitter. En 2017 el nuevo director de 13tv le despidió, junto con Francisco Marhuenda, para que El Cascabel no fuera un programa “afín al Partido Popular”. También ha sido despedido del diario La Razón.
En 2017 se conoció que, en 2011 y 2014, entre otros medios Periodista Digital y El Semanal Digital, dirigidos por Alfonso Rojo, recibieron dinero de la Consejería de Sanidad de la Comunidad de Madrid, siendo consejero Javier Fernández-Lasquetty, durante los mandatos de Esperanza Aguirre e Ignacio González del Partido Popular madrileño.
En abril de 2022 fue condenado por el Tribunal Supremo por insultar sistemáticamente al abogado Gonzalo Boye. La condena fue de 5000 euros de multa y a tener que difundir en Periodista Digital, medio que dirige, y en sus cuentas de Facebook y Twitter' el encabezamiento y la parte dispositiva de la sentencia.
En octubre de 2022 fue condenado por calificar de proetarras a unos jóvenes incluso después de que una causa contra ellos se hubiese archivado.
Alfonso Rojo frivoliza sobre su trabajo de tertuliano declarando que "es mejor que trabajar".