Regreso a la Argentina
Regresó a la Argentina en 1991, donde se desempeñó entre 1993 y 1996 como director de Aerolíneas Argentinas. Cuando se desempeñaba como tal, trabajó como lobbista de empresas españolas en Argentina. El político y sindicalista Ariel Basteiro llamó su gestión como “período de gran desgaste” para aquella empresa, explicando que bajo la gestión de Bettini se movieron los intereses de Argentina a España, específicamente hacia la aerolínea española estatal, Iberia. Según Basteiro, Bettini promovió una estrategia comercial para la aerolínea que involucró pedir prestados cien millones de dólares, vender bienes raíces, equipos y aeronaves, y recortar los servicios. El resultado fue una importante pérdida de cuota de mercado para Iberia.
Durante la presidencia de Carlos Menem, fue asesor del Ministerio de Justicia bajo las gestiones de Jorge Maiorano, Rodolfo Barra y Elías Jassán. Fue jefe de Gabinete del procurador Nicolás Becerra entre 1998 hasta el retiro de éste en 2004.
Durante 1993 y 1996, fue miembro del comité organizador de IDEA (Instituto para el Desarrollo Empresarial de la Argentina) y miembro del Patronato de la Fundación Euroamérica. Fue el representante argentino al encuentro anual de la comisión de la ONU sobre Prevención del Crimen en Viena (1994, 1995) y la conferencia Internacional de Defensores del Pueblo en Wellington, Nueva Zelanda, en 1994.
En diciembre de 1999, Patricia Bullrich, de pasado montonero, en ese entonces secretaria de Política Criminal, denunció a Bettini al fiscal federal Jorge Urso por corrupción, específicamente por intentar sobornar a la misma Bullrich, supuestamente en relación con sus funciones como representante de una empresa española, Dycasa, para conseguir un contrato para renovar y construir prisiones en Argentina. Los dichos de Bullrich fueron investigados por la Oficina Anticorrupción, que sugirieron procesarlo, o al menos, inhabilitarlo para cargos públicos. El asunto nunca llegó a juicio.
Embajador en España
Bettini fue Embajador ante el Reino de España y el Principado de Andorra entre 6 de agosto de 2004 hasta 2015, cuando asumió Mauricio Macri. Sirvió bajo las presidencias de Néstor Kirchner y Cristina Fernández de Kirchner. Patricia Bullrich abiertamente lo criticó, diciendo que era inapropiado tenerlo como Embajador. Bullrich
Participación en foros internacionales
Además de los citados cargos diplomáticos, Bettini intervino en ámbitos multilaterales vinculados con la administración pública y la cooperación jurídica. En la década de 1990 representó a la Argentina en reuniones de la Organización de las Naciones Unidas sobre prevención del delito y participó en conferencias internacionales de defensores del pueblo.